在病理方面古脉学亦多是以辨析的方法论述有关主病的，大约可以分为以下几种形式。
“错举”脉证种种变动以说明主病与病机这种情况是很多的。例如《素问·脉要精微论》：“徵其脉小色不夺者新病也，徵其脉不夺，其色夺者此久病也，徼其脉与五色俱夺者此久病也，徵其脉与五色惧不夺者，新病也。”“有脉俱沉细数者少朗厥也、沉细数数者寒也，浮而散者为朐仆。”“胃之大络，名日虚里，贯鬲络肺，出于左乳下，其动应衣（按当依《太素》作手）脉宗气也，盛喘徵绝者则病在中，结而横有积实，绝不至日死，乳之下其动应衣宗气泄也。‘尺脉缓涩（按当作尺缓脉涩）谓之解亦。安卧脉盛，谓之脱血。尺涩脉滑，谓之多汗。尺寒脉细，谓之后泄。脉尺粗常热者，谓之热中等”。对此仲景书中亦有很多精辟的论述，如《伤寒·太阳篇》：“伤寒一日，太阳受之，脉若静者，为不传，颇欲吐，若躁烦，脉数急者，为传也。”《伤寒论·少阳篇》：“伤寒三日，少阳脉小者欲己也。”《伤寒论-少阴篇》：“少阴病脉徵，不可发汗，亡阳故也。阳已虚尺脉弱涩者，复不可下之。”“少阴病下利脉微者，与白通汤，利不止，厥逆无脉，干呕烦者，白通加猪胆汁汤主之。服汤脉暴出者死，微续者生。”这些都不是单纯的讲什么脉主什么瘸，或什么病应见什么脉，面是观察脉的变动以得病的机转。
又如《伤寒沦·厥阴篇》：“伤寒脉迟六七日，而厦与黄芩汤彻其热，脉迟为寒，今与黄芩汤，复除其热，腹中应冷，当不能食，今反能食，此名除中，必死。”在这不是一般概念上的以脉定死生的问题，面是参合脉证以伺其病理机制，定出除中证的诊断辨证及病机转归，可谓精绝，确是充分应用了脉法在辨证中的作用，这与“迟脉主寒”的呆板说法和认识相去何啻千里。又如《金匮要略·痉湿喝病脉证并治第二》：“太阳病其证备、身体强、凡几然，脉反沉迟，此为痉，栝萎桂枝汤主之。”以脉为病机徵为辨证的板据，与后世一般的以脉证相反为凶为逆之囫囵说法是不同的。又如《金匮要略·胸痹心痛短气病脉证并治第九》：“师日：去脉当敢太过不及，阳徵阴弦，即胸痹面病，所以然者，责其极虚也。今阳虚知在上焦，所以胸痹心痛者，以其阴弦故也。”是以脉析病机。《金匮要略·脱满寒疝宿食病脉证并治第十》：“趺阳脉徵弦，法当服满，不满者必便难，两胠疼痛，此虚寒从下上也，当以温药脱之。”
于主证分首次与从正反两方面辨病机合观，可见古人论脉主证并不是并列平铺的。《金匮要略·惊悸吐衄下血胸满疾血病脉证并治第十六》：“病者如热状，烦满口干燥而渴，其脉反无热，此为阴伏，是瘀血也，当下之。”此证之脉象表现如按后世之法，脱然脉象没有热象就不必考虑脉的问题了，但仲景不然，却是从这个无热伺出证属阴伏得出瘀血的病机，无热二字看似宏观甚至于笼统，但正是由此辨析出精确的病机和诊断。可证有时仲景似粗_面实精，后人就似精面实际上往往粗疏的很了。再举《金般要略》对于一个病系统的利用脉诊以伺病机的情况，如《金匮要略·呕吐哕下利病脉证并治第十七》下利中的若干条脉象，在病机上的意义非常明显。如：“下利脉沉弦者—重，脉大者为来止，脉微弱数者，为欲自止，虽发热不死。”“下利手足厥冷，无脉者，灸之不温，若脉不通，反徵喘者死，少阴负趺阳者为顺也。“下利有徵热而渴，脉弱者，今自愈。”“下利脉披而渴者，今自愈，设不差，必清脉血，以有热数也。”“下利脉反弦，发热身汗者自愈。”“下利寸脉反浮数，尺中自涩者，必清脓血。”“下利脉厦而迟，其人而少赤，身有微热。下利清谷者，必郁冒汗出面解，病人必微厥，所以然者，其面戴阳，下虚故也。‘下利后脉绝，手足厥冷，啐时脉还，手足温者生，脉不还者死。”“下利三部脉皆平，按之心下坚者急下之，宜大承气汤。”“下利脉反滑者，当有所去，下乃愈，宜大承气汤。”对下利证通过脉证的辨析得出不同的病机，否则某些脉就很难说它在下利诊断辨证中有多大意x，尤其是下利三部脉皆平一条，由于下利三部脉不可能是皆平的，再加上按之心下坚的证确定其病机面决定用急下之法，这就绝非某些脉无变化或脉证不符等一般理解所能做出的了。
另外《金匮要略》在讨论病机时常常使用寸口趺阳、少阴等脉综合对比分析的方法。这方面的条文是很多的，仅举一例以见其余。如《金匮要略·水气病脉证并治第十四》：“师日：寸口脉沉面迟，沉则为水，迟则为寒，寒水相搏：趺阳脉伏，水谷不化，脾气衰则鹜溏，胃气衰则身肿，少阳脉卑，少阴脉细，男子则小便不利，妇女则经水不通，经为血，血不利则为水，名曰血分。”辨证的，合理的集中了各种脉诊的长处，用于临床辨证以得病机，其法是以寸口为主，其次是趺阳，（趺阳与人迎意同，都是阳明脉）适当的有选择的根据需要采用少阴、少阳等等，熔通诊法、阴阳诊法（人迎脉口诊、尺寸诊等）及独取寸口法于一炉，以尽可能简的形式发挥了全面系统的脉诊的长处。
总之，仲景书以脉诊析病机的内容是主要的方法，具体条文当然是指不胜屈的。在平脉辨证中脉诊名符其实地起到它应起的作用。
用对比的方法辨脉和病机在古脉学中尤为常见，这可能是与中医的理论体系的基础是阴阳有关。因为二分法在中医学的各个领域中都是表现得突出的，脉诊亦不例外，如《素问·脉要精微论》：“来疾去徐，上实下虚，为厥巅疾；来徐去疾，上虚下实，为恶风也。”“沉细数散者寒热也，浮而散者为晦仆。”“诸过者切之，涩者阳气有余也，滑者阴气有余也，阳气有余，为身热无汗，阴气有余，为多汗身寒。”《紊问·平人气象论》说：“脉盛滑坚者曰，病在外；脉小实而坚者，病在内．；脉小弱以涩，谓之久病；脉浮滑而疾者，谓之新病。脉滑日风，脉涩日痹、缓而滑日热中，盛而紧日胀。”《素问-玉机真脏论》说：“病热脉静，泄而脉大，脱血而脉实，病在中脉实坚，病在外脉不实坚者皆难治。”又如《灵枢·禁服》：“寸口主中，人迎主外，两者相应，俱往俱来，若引绳大小齐等，春夏人迎微大，秋冬寸口微大，如是者，名曰平人。”继之便是以人迎寸口变化的对比以得病机的内容。
《难经》是以各种形式来进行脉的对比以反应阴阳学说和病理病机的。如《难经·三难》：“脉有太过有不及，有阴阳相乘，有覆有溢，有关有格何谓也？然，关之前者，阳之动也，脉当九分面浮，过者法曰太过，减者法日不及，逐上鱼为溢，为外关内格，此阴乘之脉也。关之后者，阴之动也，脉当一寸而沉，过者曰太过，减者法曰不及，遂人尺为覆，为内关外格，此阳乘之脉也。”《难经·四难》说：“脉有阴阳之法，何谓也？然，呼出心与肺吸人肾与肝，呼吸之间，脾受谷味也，其脉在中。浮者阳也，沉者阴也，故日阴阳也。谓浮者阳也，滑者阳也，长者阳也，沉者阴也，短者阴也，涩者阴也。”《难经·六难》：“脉有阴盛阳虚，阳盛阴虚，何谓也？然浮之损小，沉之实大，故曰阴盛阳虚，沉之搅小，浮之实大，故日阳盛阴虚，是阴阳虚实之意也。”《难经·九难》：“何以别知脏腑之病？然数者腑也，迟者脏也，数则为热，迟则为寒，诸阳为热，诸阴为寒，故以别知脏腑之病也。”《难经·十四难》：“上部有脉，下部无脉，其人当吐，不吐者死，上部无脉，下部有脉虽困无能为害。”《难经·二十难》：“经言脉有伏匿，伏匿于何脏，以言伏匿也？然谓阴阳更相乘更相伏也。脉居阴部，而反阳脉见者，为阳乘阴也，脉虽时沉涩而短，此谓阳中伏阴也。脉居阳部而反阴脉见者，为阴乘阳也，脉虽时浮滑面长，此谓阴中伏阳也。重阳者狂，重阴者癫，脱阳者见鬼，脱胡者目盲。”更为明确地反应出脉的对比的性质，其来源正是出于阴阳及这个认识范畴的。
在仲景书中《伤寒论·辨脉法》首先就提出：“脉有阴阳何谓也？答日：凡脉大浮数动滑此名阳也；脉沉涩弱弦微，此名阴也。凡阴病见阳脉者生，阳病．见阴脉者死。”提出了“阴阳力基本认识的脉象对比方法。具体地运用对比方法，以得病机的论述是很多的，例如“辨脉法”中有：“病人若发热，身体痛，病人自卧，师到诊其脉沉而迟者，知其差也。何以知之。若表有病者，脉当浮大，脉反沉迟，故知愈也。假令病人云，腹内卒痛，病人自坐，师到脉之，浮而大者，知其差也，何以知之，若里有病者，脉当沉面细，今脉浮大，故知愈也。”《伤寒论·辨太阳病脉证并治中第二》：“太阳中风脉浮紧，发热恶寒身疼痛，不汗出而烦躁者，大青龙汤主之。若脉微弱，汗出恶风者，不可服之，服之则厥逆，筋塌肉膶，此为逆也。”用不同脉象的对比以分析其病机。《伤寒论·辨阳明病脉证并治第八》：“伤寒若吐若下后不解，不大便五六日，上至十余日，日脯所发潮热，不恶寒，独语，如见鬼状，若剧者，发则不识人，循衣摸床，惕而不安，微喘直视，脉弦者生，涩者死。”从病视进而论断其生死。又如：“阳明病谵语，发潮热，脉滑而疾者，小承气汤主之。而与承气汤一升，腹中转气者，更服一升，若不转气者，匆更与之。明日又不大便，脉反微涩者，里虚也，为难治，不可更与承气汤也。”从脉证治及腹药反映等各个方面结合起来对比以析病机。
又如《伤寒论·辨阴阳易差后劳复病脉证并治第十四》：“伤寒差以后，更发热，小柴胡汤主之。脉浮者以汗解之，脉沉实者，以下解之。”说明大病差后，再次发热的性质有表里之不同辨证而以脉象得其病机。《金匮要略·肺瘘肺病咳逆上气病脉证并治第七》对肺瘙肺痈的诊断最后着重提出：“脉数虚者有肺痿，数实者为肺痈。”又“咳而脉浮者，厚朴麻黄汤主之，脉沉者，释漆汤主之。”以脉象对比解决辨证与治疗问题。《金匮要略·水气病脉证并治第十四》：“师日：病有风水，有皮水，有正水，有石水，有黄汗。风水其脉自浮，外证骨节疼病，恶风，皮水，其脉亦浮，外证胕肿，按之没指，不恶风，其腹如鼓，不渴，当发其汗。正水其脉沉迟，外证自喘，石水，其脉自沉，外证腹满不喘。”以浮沉二脉及兼脉证候等，分析表水、里水两类的病机。又：“水之为病，其脉沉小，属少阴。浮者为风，无水虚胀者为气。水，发其汗即已，脉沉者，宜麻黄附子汤，浮者宣杏子汤。”尤较上条为简洁。又如《金匮要略·疮病浸淫病脉证并治第十八》：“肠痈者，少腹肿病，按之即痛如淋，小便自调，时时发热，自汗出，复恶寒，其脉迟紧者，脓未成，可下之当有血，脉洪数者脓已成不可下也。大黄牡丹汤主之。”以迟紧洪数两种脉象的对比以测成脓与否兼及治法，至今临床仍有非常现实的意义，非如后世伪撰《脉诀》“关内蓬芤肠里病”之理论上讲不通临床上无此事之怪说。但后人虽名家却于医案中依之（如吕复），名著中引之（如《濒湖脉学）），真“咄咄怪事”。临床中见肠痈不下数千侧，从无见芤脉者，可见仲景真非后人可及，其著作亦非后人著作可及。
内难仲景诸书中以脉象对比方法得痿机者俯拾即是，并联系列病因病理辨证治疗及预后等等。
分析脉象变化的程度亦是表得病机的重要方法，自然它亦会联系到生理、病理乃至预后等问题。例如《内经》中论述季节、五脏，六经的生理、病理，死证脉对就是用某些脉象结合胃气的有无多少，亦就是具体脉象的突出程度，来说明其机制的。
除此以外结合临床病证的例子亦很多。例如《素问·平人气象论》：“人一呼脉再动，一吸脉亦再动，呼吸定息，脉五-动，闰以太息，命日平人，平人者不病也。常以不病调病人，医不病，散为病人平息以调之为法。人一呼脉一动，一吸脉动！日步气，一人呼脉三动，一吸脉三动而躁，尺热日病温，尺不热脉滑日病风，脉涩日痹，人一呼脉四动以上日死，脉绝不至日死，乍疏乍数日死。”又如《灵枢·禁服》：“人迎大一倍子寸，病在足少阳，一倍而躁，在手少阳；人迎二倍，病在足太阳，二倍而躁，病在手太阳；人迎兰倍，病在足阳明，三倍而躁，病在手阳明；盛则为热，虚则为寒，紧则为痛痹，代则乍甚乍间，盛则泻之，虚则朴之，紧痛则取之分肉，代则取血络且饮药，陷下则灸之，不盛不虚，以经取之。名日经刺。人迎四倍者，且大且数，名日溢阳，溢阳为外格死不治，必审按其本来，察其寒热，以验其脏腑之痈。寸口大于人迎一倍，病在足厥阴，一倍而燥，在手心主，寸口二倍，病在足步阴，二倍而燥，在手少阴，寸口三倍，病在足太阴，三倍而燥，在手太阴，盛则胀满寒中食不化，虚则热中出糜，少气，溺色变，紧则痛痿，代则乍痛乍止，盛则泻之，虚贝补之，紧则先刺而后灸之，代则取血络而后调之，陷下则徒灸之。陷下者脉血传于中，中有著血，血寒故宜灸之，不盛不虚以经取之。寸口四倍者，名目内关，内关者且大且数，死不治，必审察其本末之寒温，以验其脏腑之病。”又如《素问·三部九候论》：“九候之相应也，上下若一，不得相失，一候后则病，二候后则病甚，三候后则病危。所谓后者，应不俱也。”又如《灵枢·邪气脏腑病形篇》：“心脉急甚者为瘿疯，微急为心痛引背，食不下，缓甚为狂笑，微缓为伏梁在心下，上行时唾血。大甚为喉吤，微大为心痹引背，善泪出。小甚为善哕，微小为消瘅、滑甚为善渴，微滑为心疝引脐，小腹鸣。涩甚为暗，微涩为血溢，维厥，耳鸣颠疾。” 《灵枢·根结篇》：“一日一夜五十营者，五脏皆受气，持其脉口，数其至也，五十动而不一代者，五脏皆受气，四十动一代者，一脏无气，三十动一代者，二脏无气，二十动一代者，三脏无气，一动一代者，四脏无气，不满十动一代者，五脏无气，预之短期。”这不但从程度上说明病机亦说明了预后。在《难经·三难》：“三难日：脉有太过，有不及，关前者，阳之动也，脉当九分而浮，过者法日太过，减者法日不及。关以后者阴之动也，脉当一寸而沉，过者法日太过，减者法日不及……”《难经·十难》对脉有所谓十变之说，谓：“十难曰，一脉十变者何谓也？然五邪刚柔相逢之意也，假令心脉急者，肝邪于心也，心脉微急者，胆邪于小肠也，心脉大甚者，心邪白干心也，心脉微大者，小肠邪自于小肠也，心脉缓甚者，脾邪于心也，心脉微缓者，胃邪于小肠也，心脉涩甚者，肺邪于小肠也，心脉微涩者，太阳邪于小肠也，心脉沉甚者，肾邪于心也，心脉微沉者，膀胱邪于小肠也。五脏各有刚柔邪，故令一脉辄变为十也。”《难经·十四难》：“十四难日：脉有损至何谓也？然，至之脉，一呼再至日平，三至日离经，四至日夺精，五至日死，六至日命绝，此死之脉也。何谓掼，一呼一至日离经，二呼一至曰夺精，三呼一至日死，四呼一至日命绝，此损之脉也，至脉从下上，损脉从上下也。”随后就对不同程度的损和至脉，结合五脏及其所荣做主病的描述，这里当然亦含有病机的意义。
在《伤寒论-辨脉法》中亦有：“跌阳脉浮而数，浮则伤胃，数则动脾，此非本病，医特下之所为也，荣卫内陷，其数先微，脉反但浮，其人必大便鞭，气噫而除，何以言之，本以数脉动脾，其数先微，故知脾气不治，大便鞭气噫而除。今脉反浮，其数改微，邪气独留，心中则饥，邪热不杀谷，潮热发渴，数脉当迟缓，脉因前后度数如法，病者则饥，数脉不时，则生恶疮也。”以数脉的程度来分析病机。又如在《金匮要略·血痹虚劳病脉证并治第六》中有：“夫男子平人脉大为劳，极虚亦为劳。”“劳之为病，其脉浮大，手足烦，春夏剧，秋冬瘥，阴寒精自出，酸削不能行。”按虚脉为浮大而空软的脉象，浮大为劳极虚亦为劳，从脉上讲有程度轻重的问题，但性质是一数的。
《金匮要略·痰饮咳嗽病脉证并治第十二》有：“夫病人饮水多，必暴喘满。凡食少饮多，水停心下，甚者则悸，微者短气，脉双弦者寒也，皆大下后喜虚，脉偏弦者饮也。”以双弦单弦为程度上的区别，并以见病机之不同。《金匮要略》论水气病时谓风水其脉自浮，皮水其脉亦浮，语意之间，就有不同。石水其脉自沉，正水其脉沉迟。与风水皮水之语意亦类似，说明风水的脉浮与石水的脉沉是绝对的，典型的，其程度要重，而皮水的亦浮，正水的沉迟，就是前者亦属于浮脉，后者的沉又有兼脉存在，其性质就与风水、石水的浮沉脉都有程度性质上的差别了，结合病机亦是有其相关性质的。
从预后（生死）脉中亦反映出对病机的关系，例如《内经》于脉是最重胃气，认为无胃气的脉是死脉，凡季节脉与五脏脉、六经脉等无胃气即是死脉，换句话说就是失去柔和和过分刻露的有关脉象，例如春弦、夏钩、秋毛、冬石等等，这实际上是个脉形程度变化问题。亦有从脉的盛虚至数的程度变化以定死证的。如《内经》一再提出的人迎、脉口盛大躁数等情况，以分证的轻重位置的方法，至其极端名为关或格则为死证。
又代脉若干动一止几脏无气的说法，亦是结合程度的。有时亦因为疾病的传化而成死证。如《素问·玉机其脏论》说：“五脏受气于其所生，传之于其所胜，气舍于其所生，死于其所不胜，病之且死，必先传行至其所不胜病乃死。此言气之逆行也，故死。”例如：“肝受气于心，传之于脾，气舍于肾，至肺而死。”等等。结合病证以论脉主死证之处亦很多，如《素问·三部九候论》：“形盛脉细少气不足以息者死，形瘦脉大胸中多气者死。”“形气相得者生、参伍不调者病，三部九候皆相失者死，上下左右之脉相应如参舂者病甚，上下左右相失不可数者死。中部之候虽独调，与众脏相失者死，中部之候相减者死。”“九候之脉，皆沉细悬绝者为阴主动，故以夜半死。盛躁喘数者为阳主夏，故以日中死。是故寒热病者以平旦死。
热中及热病者以日中死，病风者以日夕死，病水者以夜半死。其脉乍疏乍数，乍迟乍疾者，日乘四季死。形肉已脱九候虽调犹死。”又如《素问-评热病论》有：“黄帝问日：有病温者，汗出辄复热，而脉躁疾，不为汗衰，狂言不能食，病名为何？岐伯对曰：病名阴阳交，交者死也。帝日：愿闻其说：岐伯日：人所以汗出者，皆生于谷，谷生于精，今邪气交争于骨肉而得汗者，是邪却而精胜也，精胜则当能食而不复热，复热者，邪气也，汗者精气也。今汗出而辄复热者，是邪胜也，不能食者精无俾也，病而留者，其寿可立而倾也。且夫热论曰：汗出而脉尚燥盛者死，今脉不与汗相应，此不胜其病也，其死明矣。狂言是失志，失志者死。今见三死，不见一生，虽愈必死也。”通过病机的分析，以证明其为死证。
《难经·十七难》：“诊病若闭目不欲见人者，脉当得肝脉强急而长，而反得脾脉浮短而涩者，死也。病若开目而渴，心下牢者，脉当得紧实而数，而反得沉濡而微者死也。病若吐血复鼽衄血者脉当沉细，而反浮丈而牢者死也。病若谗言妄语，身当有热，脉当洪大，而反手足厥冷，脉沉细而微者死也。病若大脱而泄者，脉当微细而涩，及紧大而滑者死也。”是用对比的方法从病机上辨生死的，仲景书一般是通过辨证得出病机及死证的认识的。例如《伤寒论·辨脉法》：“脉浮而洪身汗如油，喘而不休，水浆不下，形体不仁，乍静乍乱，此为命绝也。”浮洪脉并不是死脉，但在这样的证候下浮洪就是死脉，这充分反应了辨证和病理机制的意义。又：“伤寒咳逆上气，其脉散者死，谓其形损故也。”散固然是严重变化的脉，但是否主死亦还是要通过与证的结合分析的，有时亦结合治法提出死脉。如《伤寒论·辨太阳病脉证并治下第七》：“结胸证其脉浮大者，不可下，下之则死。”《伤寒论·辨少阴病脉证并治第十一》：“少阴病四逆，恶寒而身躇，脉不至，不烦而躁者死。”“少阴病脉微细沉，但欲卧，汗出不烦自欲吐，至五，六日自利，复烦躁，不得卧寐者死。”《伤寒论·辨厥阴脉证并治第十二》：“伤寒六七日，脉微，手足厥冷，烦躁，灸厥阴，厥不还者死。”“下利，手足厥冷，无脉者，灸之不温，若脉不还，反微喘者死。”“伤寒下利，日十余行，脉反实者死。”都是通过脉证以及治疗反应以分析病机论断生死的。《金匮要略》中亦有类似的条文。如《金匮要略·水气病脉证并治第十四》：“脉得诸沉，当责有水，身体肿重，水病脉出者死。”以脉证相比得其病机与定其为死证。
如《金匮要略，惊悸吐衄下血胸满瘀血病脉证并治第十六》：“夫吐血，咳逆上气，其脉数而有热，不得卧者死。”我们认为古人预后中的所谓死，应当是预后极不佳之意，不都是绝对要死的。《难经》对损至脉从死进一步还有命绝。可见所谓死是有很大可能的，但不一定是绝对的。在仲景书中还提到不少“难治”的问题，这也是个由可治证到难治证、死证的一个过程。在《伤寒论》中提到不少难治的证是如所周知的，就不赘引了，在《金匮要略》中亦有类似的条文。
例如《金匮要略·眍吐哕下利病脉证并治第十七》：“趺阳脉浮而涩，浮则为虚，虚则伤脾，脾伤则不磨，朝食暮吐，暮食朝吐，宿谷不化，名日胃反，脉紧而涩，其病难治。”《金匮要略·黄疸病脉证-治第十五》：“黄疸之病，当以十八日为期，治之十日以上瘥，反剧为难治。”等等。
通过以上对古脉法的引证分析可以说明当时脉与病证是一个系列，在诊断辨证定治法，测预后等方面系统性很强。在平脉辨证的方法原则下取得的病理机制，既具非常严格的原则又很机动灵活，充分反映出脉诊在病机上的作用。
