生理性原因所导致的婴幼儿难入睡或是半夜惊醒，往往由以下5大类所造成：
环境不佳：睡眠的地方太嘈杂，衣服包被过多或过少都会影响睡眠。此外，蚊虫叮咬和突然改变睡眠地点，也会导致宝宝出现睡眠不安。
喂养不当：有些父母总是担心宝宝吃不饱，睡觉前给宝宝喂较多食物，导致宝宝夜间肠道负担过重，出现消化不良的症状，夜间就睡不安稳。建议喂粥、面等固体食物应在临睡前两三个小时喂，睡前1小时再喝一点奶。随着宝宝年龄增大，可以夜间不再进食，让全身各个器官得到全面的放松，这样宝宝睡觉就会更安稳。
安全感缺失：大部分孩子对父母都有很强的依赖感，而且随着年龄的增加，自我保护意识增强。宝宝刚睡着后不久或真正醒来之前有时候会翻身坐起来，看不到大人就哭，一般家长抚慰后都能接着睡觉。如果在一个陌生的环境睡觉，这种寻求安全感的需要尤其迫切。
不良生活习惯：睡前玩得太兴奋；睡觉时间没有规律；夜间含着奶嘴睡觉这些不良习惯容易导致睡眠不稳。建议家长在宝宝哭闹的时候，不要立刻抱，更不要逗他，多数小孩夜间醒来几分钟后又会自然入睡。如果不能自然入睡，拍一拍，安抚一下也会继续睡去。
夜间排尿：夜里有尿意的时候，宝宝会被尿意吓得哭闹，拉完尿后会自然入睡。另外尿不湿包得过紧、过胀同样会引起宝宝睡不安稳。
除了以上这些常见生理性原因外，孩子夜睡不宁还会可能有病理性原因。除了最广为人知的缺钙外，各种营养素的缺乏也可能导致睡眠质量差。像缺锌或者各种维生素导致的精神不振、烦躁不安，同样会引起宝宝睡眠不安稳，同时还会影响孩子抵抗力下降。
此外，常见的感染包括上呼吸道感染、支气管炎、肺炎、中耳炎、胃肠炎，少见的如脑膜炎、败血症，都会造成宝宝睡不安稳，另一大较为严重的病理性原因就是脑功能损害或发育不良：出生前后，由于各种原因导致宝宝的脑部受到损害，包括感染、严重黄疸、颅内出血、脑积水、缺血缺氧性脑病等等，均可能会影响宝宝的神经系统的发育。这时父母需要积极寻求医生的帮助。
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